Прошло несколько столетий после XX века. Применение ядерного и биологического оружия привело к разрушению экосистемы. Большая часть поверхности Земли загрязнена и приходит в упадок. Растения и животные в основном вымерли. Мир движется к "Большой Шестерке" — шестому массовому вымиранию. Человечество построило города в небе, переместив туда вымирающие виды. Со временем животные в этих изолированных городах эволюционировали. Благодаря искусственному скрещиванию они обрели речь, двуногую

Такада переезжает из города в деревню из-за работы отца. Она переводится в местную школу, где одноклассники настороженно относятся к ней, принимая за бога-ребёнка Матасабуро, который появляется в начале сезона тайфунов, несмотря на то что Такада является девочкой. Жизнь в деревне вызывает у неё неприязнь, и она стремится вернуться в город. Ситуация меняется после случайной встречи с богом ветра. Встреча с божеством становится поворотным моментом для Такады. Её отношение к деревенской жизни и

Третьеклассница Химэно переезжает в большой особняк в провинции. После переезда она обнаруживает, что это здание служит домом для трёх ниндзя - Акамаки (красного), Аомаки (синего) и Кииромаки (жёлтого). Ниндзя ошибочно принимают Химэно за принцессу и начинают помогать ей в решении повседневных проблем, используя свои особые навыки. Персонажи обладают способностью объединяться: при слиянии Аомаки и Кииромаки образуется Мидоримаки (зелёный), Акамаки и Аомаки формируют Мурасакимаки (фиолетовый), а

Айко проживает в синтоистском святилище, где одна из раздвижных дверей украшена незаконченной росписью. Героиня намеревается завершить рисунок, когда повзрослеет. В 17 лет у неё не остаётся времени на подобные размышления. Возле святилища появляется незнакомец. Дед Айко, являющийся главным священником, предлагает мужчине временное проживание в храме. Айко выражает несогласие с этим решением. Со временем девушка замечает, что гость не проявляет враждебных намерений. Между ними начинают