Боруто Узумаки, сын седьмого Хокагэ Наруто, поступает в академию ниндзя Деревни Листвы. Он унаследовал от отца импульсивный характер, но не стремится повторять его путь. Другие ученики воспринимают его как «сынка Хокагэ», и Боруто намерен доказать обратное. За прошедшие годы мир изменился: в Конохе появились телевидение, небоскрёбы, кондиционеры и поезда. Система синоби также претерпела изменения, хотя сами ниндзя никуда не делись. Боруто вместе с друзьями начинает расследование серии