В мегаполисе Метрополис социальное расслоение достигло крайней степени. Роботы вытеснили людей из производства, власть сосредоточена в руках государственных корпораций, а уровень преступности и предрассудков постоянно растет. Детектив Бан Шунсаку и его племянник Кэничи прибывают в город для расследования дела доктора Лоутона, которого подозревают в незаконной торговле органами. В лаборатории доктора детективы обнаруживают только девочку-киборга по имени Тима, которая не помнит своего прошлого.

События разворачиваются в 2071 году, за несколько дней до Хэллоуина. В столице Марса распространяется смертельный вирус, и правительство устанавливает награду в триста миллионов вулонгов за поимку ответственных за это. Экипаж космического корабля «Бибоп» в составе Спайка Шпигеля, Фэй Валентайн, Джета Блэка, Эдварда Вонг Хау Пепелу Тивруски IV и собаки Эйна намерен найти преступников. Однако на ту же награду претендуют и другие охотники. Центральной фигурой событий становится Винсент Воладзю,

Три бездомных персонажа — девочка, покинувшая дом, трансвестит и мужчина с алкогольной зависимостью — в канун Рождества находят брошенного новорожденного ребенка в мусоре. Они обнаруживают рядом с ним подсказки, которые могут указать на местонахождение родителей. Компаньоны решают использовать эти зацепки и отправляются на поиски по Токио. В ходе перемещения по городу персонажи сталкиваются с ситуациями и объектами, которые напоминают им об их собственном прошлом. Эти встречи заставляют их

В центре сюжета находятся два персонажа по прозвищам Чёрный и Белый. Они являются сиротами, которые установили контроль над улицами Города Сокровищ, используя насилие и запугивание. Чёрный представляет собой негативную сторону города, его действия связаны с разрушением и жестокостью. Белый, напротив, изображён как наивный и оторванный от реальности персонаж, не осознающий происходящего вокруг. Несмотря на различия в характерах, оба стремятся помешать плану якудза по превращению города в парк

Дзюн Тэндо, житель современной Японии, оказывается перемещённым в прошлое против своей воли. Представители знати принуждают его принять их сторону в военном конфликте против демонов óни. В процессе перемещения юноша попадает на территорию óни и обнаруживает, что каждая сторона конфликта имеет собственную обоснованную позицию. Пребывание среди демонов позволяет Дзюну увидеть ситуацию с другой точки зрения. Он сталкивается с необходимостью сделать выбор между двумя противоборствующими силами,