Почему-то в моём доме поселилась куноити-отаку

Главный герой Цукаса Ацуми — обычный офисный работник, ведущий уединённый образ жизни. Возвращаясь с работы вечером, он сталкивается с нападением демона. От монстра его спасает таинственная женщина в костюме ниндзя. Она представляется Сидзури Идэурой и объясняет, что демоны охотятся на людей с «кровью самурая» в жилах. Сидзури утверждает, что её сородичи издавна защищают таких людей втайне от общества.

Сидзури предупреждает Цукасу, что атаки будут учащаться. Взамен на безопасность главный герой предлагает женщине-ниндзя жильё. Выясняется, что в свободное от обязанностей ниндзя время Сидзури ведёт затворнический образ жизни и увлекается видеоиграми. По мере совместного проживания Цукаса начинает ценить общество Сидзури. Между персонажами возникают взаимные чувства, что меняет их изначально деловые отношения.