Ящик предложений Мэдаки: Сверхлюди

Мэдака Куроками является главой студенческого совета академии Хаконива. Она установила ящик для предложений, куда студенты могут круглосуточно оставлять просьбы о помощи. Вместе с членами совета - Зэнкичи Хитоёси, Коки Акунэ и Моганой Кикайдзимой - Мэдака решает различные проблемы учащихся, включая как сверхъестественные инциденты, так и личные вопросы вроде любовных переживаний.

В сюжете появляются новые персонажи и противники. Организация "План Икс" начинает действовать, отправляя своего агента Мёри Унзэн, лидера комитета общественной нравственности, для противостояния с Мэдакой. Параллельно председатель Хакама Ширануй продолжает попытки установить контроль над Мэдакой и учениками класса 13, что становится дополнительным источником напряжения в истории.