Кобаяси настолько милые, что аж больно!

Близнецы Мэгуму Кобаяси и Мицуру Кобаяси посещают разные школы — одна для девочек, другая для мальчиков. Им надоело находиться в окружении представителей своего пола, поэтому они решают временно поменяться местами. Поначалу окружающие не замечают подмены, но ситуация усложняется, когда в отношениях между персонажами начинают возникать романтические чувства.

Сюжет развивается после того, как Мэгуму, выдавая себя за брата, признаётся в любви старшекласснице Аой Санаде и целует её. Аой, которая изначально испытывала неловкость в общении с девушками, начинает сомневаться в своей ориентации. Параллельно Мицуру в образе сестры оказывается рядом с надменной королевой школы Адзусой Токугавой в уязвимый момент, что вызывает у той учащённое сердцебиение. Оба романа развиваются на фоне нераскрытого секрета о смене личностей близнецов.