Карточные бои Авангарда: Неоновый Мессия

События фильма разворачиваются после завершения сериала «Карточные бои Авангарда: Товарищество легиона». Карточная игра «Авангард» стала частью повседневной жизни многих персонажей, включая Айти Сэндо и Тосики Кая. Рутину героев нарушает Такуто Тацунаги, который объявляет турнир по приглашениям. Он собирает сильнейших игроков со всего мира, в том числе Айти и Тосики. Цель турнира — спасти мир от разрушения. Главным призом объявлена карта «Гармоничного Мессии».

Одновременно с турниром по миру прокатывается волна исчезновений воинов, владеющих картами «Авангарда». За этими событиями стоит Кодзи Ибуки. Айти и Тосики предстоит выяснить, смогут ли они предотвратить разрушение мира и одержать победу над Кодзи. Исход противостояния зависит от их способностей в игре и готовности противостоять угрозе.